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2009-02-26
Actualité médicale

Tags: mutations -  sequences -  codantes -  grande -  distance -  gene -  impliquees -  anomalie -  developpement - 
Des mutations de séquences non codantes, à grande distance d'un gène, impliquées dans une anomalie de développement - Actualité médicale
Des mutations de séquences non codantes, à grande distance d'un gène, impliquées dans une anomalie de développement

Les chercheurs de l'Inserm U781 - Université Paris Descartes, à l'Hôpital Necker-EnfantsMalades, ont démontré pour la première fois le rôle des séquences non codantes très conservées entre espèces et très éloignées d'un gène du développement, SOX9, qu'elles contrôlent de manière anormale. Ce travail a été mené sur le locus de la maladie rare dela séquence de Pierre Robin, malformations de la mâchoire et du palais chez l'enfant. Le gène SOX9 était le principal candidat pour expliquer ce syndrome. Mais en comparant des séquences géniques de familles atteintes par la maladie, les scientifiques ont démontré que le gène SOX9 n'était pas altéré. Ils se sont alors intéressés aux séquences d'ADN non codantes très éloignées du gène SOX9 et ont mis au jour leur rôle de régulation sur ce gène. De la même façon, les chercheurs ont démontré l'existence d'altérations génomiques conduisant à une anomalie d'expression de ce gène, spécifique du tissu cranio-facial. Cette découverte, publiée dans Nature Genetics, a des implications importantes en termes de stratégie de recherche de mutations en pathologie moléculaire humaine, ce d'autant plus qu'il s'agit de déserts géniques souvent centrés par un gène majeur du développement. Il s'agit ici de l'un des premiers exemples de mutation de séquences régulatrices non codantes très conservées dans le génome humain, situées à grande distance du gène sur lequel elles agissent.

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L'équipe de Stanislas Lyonnet, professeur d'université - praticien hospitalier et membre de l'unité mixte de recherche Inserm U781 - Université Paris Descartes, en collaboration avec des chercheurs écossais (Pr D. Fitzpatrick, MRC, Edinburgh) a mis en évidence le rôle surprenant des séquences non codantes très conservées dans la régulation d'un gène du développement. Elles correspondent à des segments d'ADN communs aux génomes d'espèces parfois aussi éloignées que l'homme, le poulet ou le poisson. Dites non codantes et très conservées, elles sont même plus nombreuses dans notre génome que celles codant pour les gènes.

Les chercheurs ont travaillé sur le locus de la séquence de Pierre Robin, maladie décrite par des malformations au niveau crânio-facial : un petit menton, une langue verticale et une fente du palais. Après avoir cartographié ce locus dans un vaste désert génique (2,5 mégabases) sur le chromosome 17q24, leur étude a porté sur le gène SOX9. Il s'agit d'untrès bon candidat pour expliquer cette maladie rare puisqu'il est le seul gène présent à l'intérieur de cette région et qu'il est notamment impliqué dans le développement de la mâchoire. Toutefois, il s'est avéré que sa séquence n'est pas altérée chez les personnes atteintes par ce syndrome, c'est pourquoi les chercheurs se sont intéressés aux éléments non codants présents en amont et en aval de ce gène.

Les scientifiques ont retrouvé de nombreuses séquences non codantes très conservées etce loin du gène SOX9. Ils ont donc émis l'hypothèse que des modifications au sein de ces séquences pourraient jouer un rôle dans la maladie de Pierre Robin. Des délétions et mêmedes mutations ponctuelles ont été identifiées à très grande distance du gène SOX9 chez des individus atteints du syndrome de Pierre Robin. De plus, une analyse des génomes de trois familles touchées par la maladie ...

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Article écrit le 2009-02-26 par INSERM
Source: INSERM Accéder à la source

Mots clés: mutations sequences codantes grande distance gene impliquees anomalie developpement


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Source

Dysruption of HCNEs on either side of the SOX9 gene associated with Pierre Robin sequence
S. Benko, J.A. Fantes, J. Amiel, D-J. Kleinjan, S. Thomas, J. Ramsay, N. Jamshidi, A. Essafi,S. Heaney, C. T. Gordon, D. McBride, C. Golzio, M. Fisher, Paul Perry, V. Abadie, C. Ayuso, M. Holder-Espinasse, N. Kilpatrick, M. M. Lees, A. Picard, I. K. Temple, P. Thomas, M-P. Vazquez, M. Vekemans, H. Roest Crollius, N. D Hastie, A. Munnich, H. Etchevers, A. Pelet, P. G. Farlie, D. R. FitzPatrick & S. Lyonnet.
Nature genetics, publié en ligne le 22 février 2009