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2010-05-17
Actualité médicale

Tags: topologie -  relie -  structure -  secondaire -  ARN -  conformation -  adaptation -  dynamique -  globale - 
La topologie relie la structure secondaire de l’ARN à sa conformation, son adaptation et sa dynamique globale. - Actualité médicale
La topologie relie la structure secondaire de l’ARN à sa conformation, son adaptation et sa dynamique globale.

Si les lois thermodynamiques liant les séquences d’ARN à leurs structures secondaires sont bien établies, la relation entre la structure secondaire et la conformation tridimensionnelle globale demeure mal comprise.

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Nous avons construit des cartes tridimensionnelles simples décrivant l’orientation des hélices de type-A parmi les jonctions d’ARN présentes dans la Protein Data Bank, puis nous avons rationalisé nos découvertes par de la modélisation et de la spectroscopie par résonance magnétique nucléaire. Nous montrons que les structures secondaires des jonctions présentent des contraintes topologiques aisément modélisables permettant ainsi de prédire l’orientation tridimensionnelle des hélices parmi l’ensemble des jonctions bidirectionnelles. Nos résultats suggèrent que la conformation globale de l’ARN est largement définie par des contraintes topologiques définies au niveau de la structure secondaire, et que les contacts tertiaires et les interactions intermoléculaires servent à stabiliser des conformations spécifiques au sein d’un ensemble topologique aux amplitudes définies.

Article écrit le 2010-05-17 par © Copyright InformationHospitaliere.com
Source: Science. 2010 Jan. 8, vol. 327, n° 5962, pp.202-206 Accéder à la source

Mots clés: topologie relie structure secondaire ARN conformation adaptation dynamique globale


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