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2014-06-02
Actualité médicale

Tags: Protéome - 
Vers une publication d'un catalogue protéomique - Actualité médicale
Vers une publication d'un catalogue protéomique

A l'instar de l’Human Genome Project, un consortium de recherche travaille actuellement à un protéome humain global.

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Le séquençage du génome humain, et la mise à disposition de ses données, a été un accélérateur de recherche. Mais l’expression des protéines issues de ce génome est bien plus délicate à étudier dans sa globalité, au vu de ses variations entre les tissus, les individus ou selon le contexte hormonal. Un consortium international regroupant des universités américaines, indiennes, canadiennes, chiliennes, britanniques et chinoises s’est attaqué à cette question et propose un premier brouillon de ce protéome humain (1). Les biologistes ont réalisé un profilage peptidique de 30 échantillons de tissus humains – 17 tissus adultes, 7 tissus fœtaux et 6 cellules hématopoïétiques primaires. Ils ont ainsi identifié les protéines codées par 17 294 gènes, soit environ 84 % des gènes codants identifiés chez l’homme. Mais ce n’est pas tout. Leurs analyses ont aussi mis au jour 193 nouvelles régions du génome associées à l’expression de protéines, parmi lesquelles on trouve des pseudogènes, des ARN étiquetés non codant et des cadres de lecture non conformes. Le génome réserve toujours des surprises.
Construire un protéome global, c’est aussi offrir à la communauté scientifique un catalogue en ligne des peptides et protéines exprimés dans différents tissus et à différents moments du développement humain. Mais avec seulement 30 tissus différents, ce grand livre est encore incomplet. Les chercheurs à l’origine de ce projets espèrent que d’autres les rejoindrons dans l’aventure. Ils publient, dans un second article, le détail de leur technique afin de construire un standard méthodologique et assurer la cohérence des données qui viendront compléter cet Human Proteome Project (2).

Article écrit le 2014-06-02 par Agnès Vernet pour Biofutur
Source: Nature Accéder à la source

Mots clés: Protéome


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En savoir plus


références :
(1) Kim MS et al. (2014) Nature 509, 575-81
(2) Wilhelm M et al. (2014) Nature 509, 582-7