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2002-05-01
Actualité médicale

Tags: ligne -  public -  9600% -  genome -  souris - 
Mise en ligne public de 96% du génome de la souris
 - Actualité médicale
Mise en ligne public de 96% du génome de la souris

Le consortium international pour le séquençage du génome de la souris ("International Mouse Genome Sequencing Consortium" IMGSC) a annoncé le 6 mai que la majeure partie du génome de la souris avait été regroupée et était désormais accessible gratuitement sur Internet dans les banques génomiques. L'IMGSC est un consortium constitué par le "Wellcome Trust Sanger Institute" et le "European Bioinformatics Institute" situés à Cambridge en Grande-Bretagne, le "Whitehead Institute" de Cambridge, Massachusetts, et la "Washington University School of Medecine" de St Louis, Missouri. Il est financé par le Wellcome Trust pour la Grande-Bretagne et les "National Institutes of Health" (NIH) aux Etats-Unis.

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Le consortium international pour le séquençage du génome de la souris ("International Mouse Genome Sequencing Consortium" IMGSC) a annoncé le 6 mai que la majeure partie du génome de la souris avait été regroupée et était désormais accessible gratuitement sur Internet dans les banques génomiques. L'IMGSC est un consortium constitué par le "Wellcome Trust Sanger Institute" et le "European Bioinformatics Institute" situés à Cambridge en Grande-Bretagne, le "Whitehead Institute" de Cambridge, Massachusetts, et la "Washington University School of Medecine" de St Louis, Missouri. Il est financé par le Wellcome Trust pour la Grande-Bretagne et les "National Institutes of Health" (NIH) aux Etats-Unis.
Le génome de la souris est composé de 20 chromosomes et 2,7 milliards de paires de bases, qu'il faut comparer aux 23 chromosomes et 3,1 milliards de paires de bases du génome humain. Les 33 millions de morceaux du génome de la souris séquencés dans les 4 centres de l'IMGSC, représentant 96% du génome complet, ont été regroupés, vérifiés et assemblés en utilisant deux logiciels différents, ARACHNE et PHUSION afin d'obtenir 89 séquences continues (ultracontigs) d'environ 50 mégabases. La dernière étape du projet "souris" consiste à remplir les "trous" (4% du génome) encore existant dans la séquence. Les responsables du projet espère avoir la séquence complète d'ici 3 ans.
Les techniques de séquençage sont de plus en plus sophistiquées et efficaces, ce qui a permis au consortium d'atteindre l'objectif actuel, la publication d'un "premier jet" de séquence beaucoup plus tôt que prévu initialement et avec une bien meilleure fiabilité que pour le projet génome humain. Ainsi, pour s'assurer de la fiabilité de la séquence, chaque paire de base a été séquencée en moyenne sept fois. Si les techniques continuent de se perfectionner, le génome de la souris pourrait bien être disponible avant les 3 ans prévus.
Les analyses ...

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Article écrit le 2002-05-01 par
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Mots clés: ligne public 9600% genome souris


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