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Analyse statistique des séquences biologiques
Modélisation markovienne, alignements et motifs Collection Bioinformatique, dirigée par Alessandra Carbone NUEL G., PRUM B.

Modélisation markovienne, alignements et motifs Collection Bioinformatique, dirigée par Alessandra Carbone NUEL G., PRUM B.  - Analyse statistique des séquences biologiques

Analyse statistique des séquences biologiquesest le résultat de quinze années de recherche et présente de manière synthétique et didactique une approche nouvelle fondée sur les automates finis.

L’analyse statistique des séquences génomiques — un des points forts de la recherche en bioinformatique ou en biostatistique en France — développe des outils permettant la modélisation des séquences (chaînes de Markov, chaînes de Markov cachées) ainsi que l’étude des occurrences de motifs (par une approche novatrice fondée sur les automates finis déterministes). Elle permet également la recherche automatique de gènes et d’autres signaux biologiques (annotation) et compare des séquences provenant d’espèces différentes (alignement), en particulier pour reconstruire l’histoire de leur évolution (phylogénie).

Introduction. Modélisation de séquences. Chaînes de Markov. Chaînes de Markov cachées. Motifs. Compter les motifs. Statistiques de motifs. Motifs biologiques. Alignements de séquences. Score local d’une séquence. Alignement de deux séquences. Alignements multiples. Matrices de similarité. Annexes.Bibliographies / Index.

362 p., 16 x 24, 2007 ISBN : 978-2-7462-1491-0, 55 E
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